吉林大学学科门类齐全，涵盖哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、军事学等全部12大学科门类；有本科专业121个，博士、硕士学位授权一级学科28个，硕士学位授权点278个，博士学位授权点191个，博士后科研流动站30个；有一级学科国家重点学科4个（覆盖17个二级学科），二级学科国家重点学科15个，国家重点（培育）学科4个，省重点学科78个；有12个“211工程”重点学科建设项目；有8个“985工程”科技创新平台和5个“985工程”哲学社会科学创新基地。 |
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| 【一级学科国家重点学科】 | ||
| 数学 | 化学 | |
| 机械工程 | 地质资源与地质工程 | |
注：此四个一级学科国家重点学科覆盖17个二级学科 |
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| 【二级学科国家重点学科】 | ||
| 马克思主义哲学 | 数量经济学 | |
| 法学理论 | 刑法学 | |
| 政治学理论 | 考古学及博物馆学 | |
| 原子与分子物理 | 凝聚态物理 | |
| 生物化学与分子生物学 | 材料加工工程 | |
| 微电子学与固体电子学 | 计算机软件与理论 | |
| 农业机械化工程 | 预防兽医学 | |
| 神经病学 | ||
| 【国家重点（培育）学科】 | ||
| 材料学 | 交通信息工程及控制 | |
| 基础兽医学 | 技术经济及管理 | |
| 政治经济学 | 世界经济 | 人口、资源与环境经济学 |
| 区域经济学 | 刑法学 | 民商法学 |
| 政治学理论 | 国际政治 | 社会学 |
| 人口学 | 思想政治教育 | 汉语言文字学 |
| 中国现当代文学 | 日语语言文学 | 考古学及博物馆学 |
| 历史文献学 | 基础数学 | 应用数学 |
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| “十五”期间“211工程”重点学科建设项目 | |
| 化学材料合成与理论 | 超高压等极端条件下物质结构、性质和新型功能材料 |
| 光电子学与光学 | 计算与软件科学及信息处理 |
| 汽车与工程装备设计制造 | 农业机械化工程 |
| 材料成形技术与新材料 | 资源、环境与地球圈层动力学 |
| 公路智能交通运输工程 | 神经系统疾病的病理生物学和分子酶学 |
| 马克思主义在21世纪的理论创新和人才培养 | 东北亚区域政治、经济、历史与社会发展 |
| 【“985工程”二期项目】 |
| “985工程”科技创新平台 | |
| 物质制备科学科技创新平台 | 汽车工程科技创新平台 |
| 高压科学与技术科技创新平台 | 整合生物学科技创新平台 |
| 工程仿生科技创新平台 | 集成光电子学科技创新平台 |
| 东北资源与环境科技创新平台 | 计算与软件科学科技创新平台 |
| “985工程”哲学社会科学创新基地 | |
| 东北亚研究与东北振兴哲学社会科学创新基地 | 中国边疆史地哲学社会科学创新基地 |
| 经济分析与预测哲学社会科学创新基地 | 法律与经济全球化哲学社会科学创新基地 |
| 社会发展理论哲学社会科学创新基地 | |
